Le nombre de tests RT-PCR continue de décroitre fortement entre le 16 et le 22 novembre, les délais de validation des résultats se raccourcissent nettement

Entre le 1er mars et le 22 novembre 2020, on estime que plus de 27 millions de tests RT-PCR ont été réalisés en France. Au cours de la semaine du 16 au 22 novembre, 1 395 900 tests RT-PCR ont été validés, un nombre en forte baisse (-400 000) par rapport à la semaine précédente. Dans un contexte de confinement, en l’espace de deux semaines, la baisse constatée s’élève à 900 000, et le nombre de tests revient au niveau observé à la mi-octobre, ou encore à la fin septembre.

Les délais entre prélèvement et validation des résultats des tests RT-PCR se raccourcissent nettement

La forte diminution du nombre de tests continue de s’accompagner d’une évolution positive sur les délais de validation des résultats : ceux-ci baissent de façon plus marquée entre le 16 et le 22 novembre. 66 % des tests RT-PCR validés la semaine dernière ont été prélevés dans les 24h qui précèdent (contre 52 % la semaine du 9 au 15 novembre), un niveau qui n’avait pas été atteint depuis la mi-juin. La part de tests validés en moins de 48h augmente également : 93 % contre 84 % la semaine précédente. La médiane est redescendue à 0,8 jour (contre 1,0 la semaine précédente) et la moyenne à 0,9 jour (contre 1,2 la semaine précédente).

Près de 8 départements sur 10 ont un délai médian entre prélèvement et validation du résultat inférieur à 24h

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Méthodologie

La DREES exploite les données pseudonymisées du système d’information SI-DEP, qui portent notamment sur l’ensemble des tests RT-PCR réalisés par les laboratoires d’analyse médicale, et comportent des informations à la fois sur les résultats des tests et sur leurs délais de réalisation. Le calcul des délais se fait à partir de la date de prélèvement du test (jour, heure, minute), déclarée par le laboratoire, et de la date d’intégration (jour, heure, minute) du test dans le système d’information, intégration qui doit se faire très rapidement après la validation du test.

Les statistiques présentées portent sur l’ensemble des tests RT-PCR réalisés, en date de validation du résultat. Si une même personne a réalisé successivement deux tests, ces deux tests sont donc comptés. Les données sur le nombre de tests diffèrent de celles publiées par Santé Publique France, en date de prélèvement du test. De plus, les délais ici présentés correspondent aux délais entre la date de prélèvement et la date d’intégration des résultats dans SI-DEP. Cependant, la date d’envoi des résultats aux patients par le laboratoire peut être postérieure à l’intégration des résultats dans SIDEP. Les délais entre date de prélèvement et réception des résultats par les patients pourraient donc être supérieurs à ceux mesurés via SIDEP.

Enfin, entre début mars et début juin 2020, préalablement au déploiement complet de SIDEP, la DREES a mis en place à la demande du centre de crise sanitaire un système d’information permettant de comptabiliser le nombre de tests réalisés en France, à partir des déclarations des sites réalisant les tests (et non les prélèvements comme dans SIDEP).

Dans le cadre de l’exploitation des données SIDEP, la DREES procède à quelques retraitements des données. En particulier, les tests remontés avec un pseudonyme manquant sont supprimés. Dans le cas d’un même test remonté plusieurs fois (mise à jour de certaines informations sur le patient par exemple), la DREES conserve la ligne la plus récente, à l’exception de la date d’intégration dans SIDEP dont on retient la valeur la plus ancienne, assimilée à la date de validation du résultat.