Semaine du 10 janvier au 16 janvier 2022 : Première baisse observée du nombre de tests depuis le début de la 5ème vague en novembre, les délais de validation se réduisent considérablement

Paru le 20/01/2022

Résumé

Entre le 10 janvier et le 16 janvier 2022, 11 308 800 tests RT-PCR et antigéniques pour la détection du SARS-Cov2 ont été validés (dont 70,0 % de tests antigéniques), contre 12 088 200 tests (dont 67,3 % de tests antigéniques) la semaine précédente, soit une baisse de 6,4%. Le volume de tests a connu une forte augmentation depuis début novembre, jusqu’au pic observé la semaine dernière, et semble amorcer une décrue depuis. Le volume record de tests quotidien a été atteint le 10 janvier avec plus de 2 280 000 tests validés. Avec la rentrée scolaire, il y a eu une forte augmentation du volume de tests chez les moins de 16 ans, mais on observe une chute à partir de la mi-janvier qui s’explique sans doute par la modification du protocole sanitaire dans les écoles (voir graphique 1B).

 

Les délais de validation des tests se sont raccourcis après deux semaines d’augmentation. Ce constat est probablement lié à la baisse du volume de tests, l’arrêt du criblage systématique des tests positifs (le taux de criblage minimal a été fixé à 25% pour les laboratoires) ou encore la fin des congés de Noël. Au total, 97 % des tests RT-PCR et antigéniques validés entre le 10 janvier et le 16 janvier ont été prélevés dans les 24h précédentes (contre 93 % la semaine précédente), et 99 % ont été validés le jour-même ou le lendemain du prélèvement (contre 98 % la semaine précédente). La médiane et la moyenne ont également diminué, respectivement à 0,4 et 0,6 jour (contre respectivement 0,6 et 0,7 la semaine précédente).

Graphique 1A • Nombre de tests RT-PCR et antigéniques réalisés par jour et semaine glissante

Lecture : Le 16 janvier 2022, 482 210 résultats de tests ont été validés, dont 367 706 tests antigéniques. Du 10 janvier au 16 janvier 2022, 11 308 839 résultats de tests ont été validés, dont 7 915 773 tests antigéniques.
Champ : Tests RT-PCR remontés via l’enquête DREES auprès des laboratoires entre le 1er mars 2020 et le 7 juin 2020 ; et tests RT-PCR et antigéniques avec dates de validation depuis le 7 juin 2020, remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 18 janvier 2022 5h. Du fait de la montée en charge progressive de la saisie des tests antigéniques, le nombre de tests antigéniques dans SI-DEP est sous-estimé jusqu’à fin novembre. Avant cette date, les résultats positifs associés étaient intégrés directement dans Contact-Covid afin de permettre le dispositif de contact tracing.
Source : SI-DEP - Enquête DREES Laboratoires ; calculs DREES

Le nombre de tests validés entre le 10 et le 16 janvier 2022 est en baisse pour l’ensemble des tranches d’âge à l’exception des plus jeunes (graphique 1B). Pour ces derniers, l’envolée du nombre de tests au retour des vacances scolaires n’a été qu’en partie compensée par la modification du protocole sanitaire dans les écoles qui a conduit au repli des volumes à partir du 14 janvier seulement. C’est pourquoi une hausse de 114 000 tests reste observée durant la deuxième semaine de janvier par rapport à la première. Pour toutes les autres tranche d’âge les volumes sont en repli : -382 000 tests pour les 16-25 ans, -119 000 pour les 26-40 ans, -230 100 pour les 41-65 ans, -87 000 pour les 66-75 ans et -74 000 pour les plus de 75 ans.

Graphique 1B • Nombre de tests (RT-PCR et antigéniques) sur 7 jours glissants par tranche d’âge

Lecture : Entre le 10 janvier et le 16 janvier 2022, 1 871 206 tests validés concernaient les 16-25 ans.
Champ : Tests RT-PCR et antigéniques avec dates de validation depuis le 7 juin 2020 et âge renseigné, remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 18 janvier 2022 5h.
Source : SI-DEP ; calculs DREES

La proportion de tests antigéniques réalisée est plus faible chez les plus de 75 ans (graphique 1C). Sur la semaine du 10 janvier au 16 janvier, elle augmente chez toutes les tranches d’âge à l’exception des moins de 16 ans.

Graphique 1C • Proportion de tests antigéniques réalisés parmi le total des tests RT-PCR et antigéniques (en %) par tranche d’âge, en date de validation sur une semaine glissante

Lecture : 77,4 % des tests réalisés par les 16-25 ans validés entre le 10 janvier et le 16 janvier 2022 sont des tests antigéniques.
Champ : tests RT-PCR et antigéniques avec dates de validation jusqu’au 16 janvier 2022 inclus, remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 18 janvier 2022 5h. Suppression des lignes avec pseudonymes manquants et des tests en doublon.
Source : SI-DEP ; calculs DREES.

Tableau 1 • Proportion de tests antigéniques réalisés parmi le total des tests RT-PCR et antigéniques (en %) par tranche d’âge, pour les tests validés du 10 janvier au 16 janvier 2022 et du 3 janvier au 9 janvier 2022

Lecture : 77,4 % des tests réalisés par les 16-25 ans validés entre le 10 janvier et le 16 janvier sont des tests antigéniques.
Champ : tests RT-PCR et antigéniques avec dates de validation du 3 janvier au 16 janvier 2022 inclus, remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 18 janvier 2022 5h. Suppression des lignes avec pseudonymes manquants et des tests en doublon.
Source : SI-DEP ; calculs DREES.

Le volume de tests salivaires est en légère diminution après un pic mi-janvier et concentré sur les plus jeunes âges, du fait du changement de protocole sanitaire en milieu scolaire (Graphique 1D). Pour rappel, depuis le 14 janvier, lorsqu’un enfant est « cas contact » il peut se soumettre à 3 autotests à J0, J2 et J4 alors que dans la version précédente du protocole, le premier test à J0 devait être un test PCR ou antigénique.

Graphique 1D • Nombre de tests salivaires sur 7 jours glissants par tranche d’âge

 
Lecture : Entre le 10 janvier et le 16 janvier 2022, tests RT-PCR salivaires concernaient les 0-11 ans.
Champ : Tests RT-PCR salivaires avec dates de validation depuis le 1er février 2021 et âge renseigné, remontés dans les envois quotidiens SIDEP reçus par la DREES jusqu’au 18 janvier 2022 5h. Suppression des lignes avec pseudonymes manquants et des tests en doublon.
Source : SIDEP ; calculs DREES

La médiane et la moyenne des délais entre prélèvement et validation du résultat des tests RT-PCR diminuent pour atteindre respectivement à 0,4 et 0,6 jour (contre respectivement 0,6 et 0,7 la semaine précédente) (Graphique 2).

Graphique 2 • Évolution des délais entre prélèvement et validation du résultat pour les tests RT-PCR en France

Lecture : Entre le 10 janvier et le 16 janvier 2022, la moitié des tests RT-PCR ont été validés en 0,4 jour ou moins. Sur la même période, la moyenne du délai était de 0,6 jour.
Champ : Tests RT-PCR avec dates de validation depuis le 25 juin 2020, remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 18 janvier 2022 5h. Exclusion des tests avec délais aberrants.
Source : SI-DEP ; calculs DREES

La part des tests RT-PCR validés en moins de 24 h augmente fortement pour atteindre 89 %(contre 79 % la semaine précédente) (Graphiques 3 et 4).

Graphique 3 • Distribution des délais entre prélèvement et validation du résultat des tests RT-PCR

Lecture : 99,0 % des tests RT-PCR validés entre le 10 janvier et le 16 janvier 2022 ont été prélevés dans les 72h précédentes.
Champ : Tests RT-PCR remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 18 janvier 2022 5h. Exclusion des tests avec délais aberrants.
Source : SI-DEP ; calculs DREES

Graphique 4 • Répartition des délais entre prélèvement et validation du résultat des tests RT-PCR entre le 10 janvier et le 16 janvier 2022

Lecture : 89,5 % des tests RT-PCR validés entre le 10 janvier et le 16 janvier 2022 ont été prélevés dans les 24h précédentes.
Champ : Tests RT-PCR avec dates de validation entre le 10 janvier et le 16 janvier 2022 inclus, remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 18 janvier 2022 5h. Exclusion des tests avec délais aberrants.
Source : SI-DEP ; calculs DREES

3 départements sur 4 ont un délai médian entre prélèvement et validation du résultat d’un test RT-PCR inférieur à 12 h (Cartes 1 et 2).

Carte 1 • Délais entre prélèvement et validation du résultat des tests RT-PCR par département entre le 10 janvier et le 16 janvier 2022

Lecture : Entre le 10 janvier et le 16 janvier 2022, le délai médian pour les résidents de l’Ain (01) est compris entre 0 et 0,5 jour, c’est-à-dire que plus de la moitié des tests ont un délai entre prélèvement et validation du résultat inférieur à 0,5 jour.
Champ : Tests RT-PCR avec dates de validation entre le 10 janvier et le 16 janvier 2022 inclus, remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 18 janvier 2022 5h. Exclusion des tests avec délais aberrants. Le département est le département de résidence du patient.
Source : SI-DEP ; calculs DREES

Carte 2 • Délais entre prélèvement et validation du résultat des tests RT-PCR en Île-de-France entre le 10 janvier et le 16 janvier 2022

Lecture : Entre le 10 janvier et le 16 janvier 2022, le délai médian pour les résidents des Yvelines (78) est compris entre 0,5 et 1 jour, c’est-à-dire que plus de la moitié des tests ont un délai entre prélèvement et validation du résultat inférieur à 1 jour.
Champ : Tests RT-PCR avec dates de validation entre le 10 janvier et le 16 janvier 2022 inclus, remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 18 janvier 2022 5h. Exclusion des tests avec délais aberrants. Le département est le département de résidence du patient.
Source : SI-DEP ; calculs DREES

70,0 % des tests réalisés sont antigéniques.

Les départements pour lesquels cette part est la plus importante sont la Guadeloupe (90,5 %), les Hautes-Alpes (87,5 %), et Mayotte (84,5 %) (Carte 1).

Carte 3 • Proportion de tests antigéniques par département entre le 10 janvier et le 16 janvier 2022 (en %)

Lecture : Entre le 10 janvier et le 16 janvier 2022, la part des tests antigéniques validés dans le Finistère (29) se situait entre 60 et 80 %.
Champ : Tests RT-PCR et antigéniques avec dates de validation entre le 10 janvier et le 16 janvier 2022 inclus, remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 18 janvier 2022 5h. Le département est le département de résidence du patient.
Source : SI-DEP ; calculs DREES

Sur l’ensemble des tests (RT-PCR et antigéniques) validés la semaine du 10 janvier au 16 janvier 2022, la part des tests validés en moins de 24 heures augmente et atteint 97 %, contre 93 % la semaine précédente (Graphique 5). Si l’on considère le délai en journées, et non plus en heures, ce sont 99 % des tests dont le résultat a été validé le jour ou le lendemain du prélèvement, contre 98 % la semaine précédente (Graphique 6).

Graphique 5 • Part des résultats validés en moins de 24 heures pour les tests RT-PCR et antigéniques

Lecture : 89,4 % des tests RT-PCR validés entre le 10 janvier et le 16 janvier 2022 ont été prélevés dans les 24 heures précédentes. 96,7 % des tests RT-PCR et antigéniques validés entre le 10 janvier et le 16 janvier 2022 ont été prélevés dans les 24 heures précédentes.
Champ : Tests RT-PCR et antigéniques remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 18 janvier 2022 5h. Exclusion des tests avec délais aberrants.
Source : SI-DEP ; calculs DREES

Graphique 6 • Part des résultats validés le jour ou le lendemain du prélèvement pour les tests RT-PCR et antigéniques

Lecture : 97,0 % des tests RT-PCR validés entre le 10 janvier et le 16 janvier 2022 ont été prélevés le jour-même ou la veille. 99,1 % des tests RT-PCR et antigéniques validés entre le 10 janvier et le 16 janvier 2022 ont été prélevés le jour-même ou la veille.
Champ : Tests RT-PCR et antigéniques remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 18 janvier 2022 5h. Exclusion des tests avec délais aberrants.
Source : SI-DEP ; calculs DREES

Consulter la datavisualisation

Méthodologie

La DREES exploite les données pseudonymisées du système d’information SI-DEP, qui portent notamment sur l’ensemble des tests RT-PCR réalisés par les laboratoires d’analyse médicale, et comportent des informations à la fois sur les résultats des tests et sur leurs délais de réalisation. Le calcul des délais pour les tests RT-PCR se fait à partir de la date de prélèvement du test (jour, heure, minute), déclarée par le laboratoire, et de la date d’intégration (jour, heure, minute) du test dans le système d’information, intégration qui doit se faire très rapidement après la validation du test. Les délais ici présentés pour les tests RT-PCR correspondent aux délais entre la date de prélèvement et la date d’intégration des résultats dans SI-DEP. Cependant, la date d’envoi des résultats aux patients par le laboratoire peut être postérieure à l’intégration des résultats dans SIDEP. Les délais entre date de prélèvement et réception des résultats des tests RT-PCR par les patients pourraient donc être supérieurs à ceux mesurés via SIDEP. Les statistiques présentées portent sur l’ensemble des tests RT-PCR réalisés, en date de validation du résultat.

Depuis le 17 octobre 2020, les tests antigéniques sont autorisés dans le cadre des dépistages individuels. Ils doivent être remontés depuis lors dans la base SIDEP par les laboratoires. En revanche, la saisie d’information dans SIDEP pour les professionnels de santé n’est possible que depuis le 16 novembre 2020, et a connu une phase de montée en charge. Afin d’estimer le nombre total de tests antigéniques réalisés depuis le 17 octobre 2020, la DREES utilise les données de l’Assurance maladie sur le nombre de tests remboursés en date de soins en complément des données renseignées dans SIDEP. Les tests antigéniques sont des tests pour lesquels le résultat est connu très rapidement, avec un délai entre prélèvement et validation du résultat généralement inférieur à 30 minutes.

Par ailleurs, si une même personne a réalisé successivement deux tests, ces deux tests sont donc comptés. Les données sur le nombre de tests diffèrent de celles publiées par Santé publique France, en date de prélèvement du test.

Enfin, entre début mars et début juin 2020, préalablement au déploiement complet de SIDEP, la DREES a mis en place à la demande du centre de crise sanitaire un système d’information permettant de comptabiliser le nombre de tests RT-PCR réalisés en France, à partir des déclarations des sites réalisant les tests (et non les prélèvements comme dans SIDEP).

Dans le cadre de l’exploitation des données SIDEP, la DREES procède à quelques retraitements des données. En particulier, les tests remontés avec un pseudonyme manquant sont supprimés. Dans le cas d’un même test remonté plusieurs fois (mise à jour de certaines informations sur le patient par exemple), la DREES conserve la ligne la plus récente, à l’exception de la date d’intégration dans SIDEP dont on retient la valeur la plus ancienne, assimilée à la date de validation du résultat.