Semaine du 5 au 11 juillet 2021 : la hausse du nombre de tests se poursuit, les délais de rendu des tests sont stables

Entre le 1er mars 2020 et le 11 juillet 2021, on estime qu’environ 102,5 millions de tests antigéniques et RT-PCR ont été validés par un professionnel de santé, plus précisément, 21,4 millions de tests antigéniques et 81,0 millions de tests RT-PCR dont 78,0 millions naso-pharyngés, 2,8 millions de salivaires et 180 000 en milieux divers (Graphique 1A).

Entre le 5 et le 11 juillet 2021, 2 301 500 tests RT-PCR et antigéniques ont été validés (dont 37,1 % de tests antigéniques et 1,6 % de tests RT-PCR salivaires), contre 1 968 200 (dont 30,9 % de tests antigéniques et 4,8 % de tests RT-PCR salivaires) la semaine précédente, soit une augmentation de 333 300 tests, centrée sur les 16-65 ans.

La part des tests (ensemble des RT-PCR et antigéniques) validés en moins de 24h est stable à 97 %. La médiane et la moyenne des délais entre prélèvement et validation du résultat des tests RT-PCR sont stables, respectivement à 0,4 et 0,5 jour.

Le nombre de tests validés du 5 au 11 juillet est en nette augmentation pour les personnes âgées de 16 à 65 ans (Graphique 1B).

Les tests RT-PCR salivaires sont majoritairement réalisés par des enfants âgés de 4 à 11 ans (Graphique 1C), dans le cadre de campagnes de dépistage dans les établissements scolaires. La dynamique du nombre de tests fluctue avec les ouvertures et les fermetures des établissements scolaires. Depuis cinq semaines, le nombre de tests salivaires diminue, et la baisse s’est nettement accentuée sur les deux dernières semaines.

La médiane et la moyenne des délais entre prélèvement et validation du résultat des tests RT-PCR sont stables, respectivement à 0,4 et 0,5 jour (Graphique 2).

La part des tests RT-PCR validés en moins de 24 h est stable à 95 % (Graphique 3).

95 % des départements ont un délai médian entre prélèvement et validation du résultat d’un test RT-PCR inférieur à 12 h (Cartes 1 et 2).

Un peu moins de 4 tests sur 10 sont antigéniques.

Les départements où la part des tests antigéniques est la plus élevée sont Mayotte (976), Paris (75) et la Corse-du-Sud (2A) (Carte 3).

 
Les tests salivaires représentent quant à eux moins de 10 % des tests réalisés dans tous les départements (Carte 4).

Sur l’ensemble des tests (RT-PCR et antigéniques) validés la semaine du 5 au 11 juillet 2021, la part des tests validés en moins de 24 h s’élève à 97 % (Graphique 5), comme la semaine précédente. Si l’on considère le délai en journées, et non plus en heures, ce sont 99 % des tests dont le résultat a été validé le jour ou le lendemain du prélèvement (Graphique 6), comme la semaine précédente.

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Méthodologie

La DREES exploite les données pseudonymisées du système d’information SI-DEP, qui portent notamment sur l’ensemble des tests RT-PCR réalisés par les laboratoires d’analyse médicale, et comportent des informations à la fois sur les résultats des tests et sur leurs délais de réalisation. Le calcul des délais pour les tests RT-PCR se fait à partir de la date de prélèvement du test (jour, heure, minute), déclarée par le laboratoire, et de la date d’intégration (jour, heure, minute) du test dans le système d’information, intégration qui doit se faire très rapidement après la validation du test. Les délais ici présentés pour les tests RT-PCR correspondent aux délais entre la date de prélèvement et la date d’intégration des résultats dans SI-DEP. Cependant, la date d’envoi des résultats aux patients par le laboratoire peut être postérieure à l’intégration des résultats dans SIDEP. Les délais entre date de prélèvement et réception des résultats des tests RT-PCR par les patients pourraient donc être supérieurs à ceux mesurés via SIDEP. Les statistiques présentées portent sur l’ensemble des tests RT-PCR réalisés, en date de validation du résultat.

Depuis le 17 octobre, les tests antigéniques sont autorisés dans le cadre des dépistages individuels. Ils doivent être remontés depuis lors dans la base SIDEP par les laboratoires. En revanche, la saisie d’information dans SIDEP pour les professionnels de santé n’est possible que depuis le 16 novembre, et a connu une phase de montée en charge. Afin d’estimer le nombre total de tests antigéniques réalisés depuis le 17 octobre, la DREES utilise les données de l’Assurance maladie sur le nombre de tests remboursés en date de soins en complément des données renseignées dans SIDEP. Les tests antigéniques sont des tests pour lesquels le résultat est connu très rapidement, avec un délai entre prélèvement et validation du résultat généralement inférieur à 30 minutes.

Par ailleurs, si une même personne a réalisé successivement deux tests, ces deux tests sont donc comptés. Les données sur le nombre de tests diffèrent de celles publiées par Santé Publique France, en date de prélèvement du test.

Enfin, entre début mars et début juin 2020, préalablement au déploiement complet de SIDEP, la DREES a mis en place à la demande du centre de crise sanitaire un système d’information permettant de comptabiliser le nombre de tests RT-PCR réalisés en France, à partir des déclarations des sites réalisant les tests (et non les prélèvements comme dans SIDEP).

Dans le cadre de l'exploitation des données SIDEP, la DREES procède à quelques retraitements des données. En particulier, les tests remontés avec un pseudonyme manquant sont supprimés. Dans le cas d'un même test remonté plusieurs fois (mise à jour de certaines informations sur le patient par exemple), la DREES conserve la ligne la plus récente, à l'exception de la date d'intégration dans SIDEP dont on retient la valeur la plus ancienne, assimilée à la date de validation du résultat.