Semaine du 26 avril au 2 mai 2021 : hausse du nombre de tests salivaires réalisés suite à la reprise scolaire, les délais de rendu des tests sont stables

Paru le 06/05/2021

Résumé

Entre le 1er mars 2020 et le 2 mai 2021, on estime qu’environ 80,6 millions de tests antigéniques et RT-PCR ont été validés par un professionnel de santé, plus précisément, 15,4 millions de tests antigéniques et 65,2 millions de tests RT-PCR dont 64,2 millions naso-pharyngés, 841 000 salivaires et 128 000 en milieux divers.

 

Entre le 26 avril et le 2 mai 2021, 2 198 000 tests RT-PCR et antigéniques ont été validés (dont 25,7 % de tests antigéniques et 8,3 % de tests RT-PCR salivaires), contre 2 233 000 (dont 30,2 % de tests antigéniques et 1,1 % de tests RT-PCR salivaires) la semaine précédente, soit une diminution de 35 000 tests. Toutefois, la baisse du nombre de tests RT-PCR naso-pharyngés et antigéniques, liée notamment à la présence d’un jour férié, le 1er mai, est en grande partie compensée par la hausse du nombre de tests salivaires. En effet, avec la réouverture des écoles primaires, le nombre de tests salivaires augmente fortement et atteint 183 000 tests validés sur la semaine du 26 avril au 2 mai. Il retrouve le niveau atteint avant la fermeture des établissements scolaires.

La part des tests (ensemble des RT-PCR et antigéniques) validés en moins de 24 h diminue légèrement, et atteint 93 %, contre 94 % la semaine précédente. La médiane et la moyenne des délais entre prélèvement et validation du résultat sont stables, respectivement à 0,4 et 0,5 jour.

En lien avec la reprise des tests salivaires dans les établissements scolaires, le nombre de tests effectués par les personnes de moins de 15 ans augmente fortement sur la semaine du 26 avril au 2 mai. En revanche, le nombre de tests réalisés par les personnes de 15 à 65 ans poursuit sa diminution. Il reste stable pour les personnes âgées de plus de 65 ans (Graphique 1B).

Les tests RT-PCR salivaires sont majoritairement réalisés par des enfants âgés de 4 à 11 ans (Graphique 1C). Le nombre de tests salivaires a chuté la semaine du 5 au 11 avril 2021 lors de la fermeture des établissements scolaires. Il augmente depuis la réouverture des écoles primaires le 26 avril et a dépassé le niveau atteint avant la fermeture des écoles.

La médiane et la moyenne des délais entre prélèvement et validation du résultat sont stables, respectivement à 0,4 et 0,5 jour (Graphique 2).

La part des tests RT-PCR validés en moins de 24 h est en légère diminution à 91 %, contre 92 % la semaine précédente (Graphique 3).

Cette baisse est liée à la présence d’un jour férié pendant la semaine.

 
8 départements sur 10 ont un délai médian entre prélèvement et validation du résultat d’un test RT-PCR inférieur à 12 h (Cartes 1 et 2).

Plus d’un test sur 4 est antigénique.

Les départements où la part des tests antigéniques est la plus élevée sont Mayotte (976), Paris (75), la Moselle (57) et la Seine-Saint-Denis (93) (Carte 3).
 

Les tests salivaires représentent quant à eux moins de 10 % des tests réalisés dans près de 75 % des départements, et moins de 20 % dans tous les départements, excepté les Hautes-Pyrénées, les Ardennes, l’Ardèche et le territoire de Belfort.
(Carte 4).

Sur l’ensemble des tests (RT-PCR et antigéniques) réalisés la semaine du 26 avril au 2 mai 2021, la part des tests validés en moins de 24 h s’élève à 93 % (Graphique 5), contre 94 % la semaine précédente. Si l’on considère le délai en journées, et non plus en heures, ce sont 99 % des tests dont le résultat a été validé le jour ou le lendemain du prélèvement (Graphique 6), comme la semaine précédente.


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Méthodologie

La DREES exploite les données pseudonymisées du système d’information SI-DEP, qui portent notamment sur l’ensemble des tests RT-PCR réalisés par les laboratoires d’analyse médicale, et comportent des informations à la fois sur les résultats des tests et sur leurs délais de réalisation. Le calcul des délais pour les tests RT-PCR se fait à partir de la date de prélèvement du test (jour, heure, minute), déclarée par le laboratoire, et de la date d’intégration (jour, heure, minute) du test dans le système d’information, intégration qui doit se faire très rapidement après la validation du test. Les délais ici présentés pour les tests RT-PCR correspondent aux délais entre la date de prélèvement et la date d’intégration des résultats dans SI-DEP. Cependant, la date d’envoi des résultats aux patients par le laboratoire peut être postérieure à l’intégration des résultats dans SIDEP. Les délais entre date de prélèvement et réception des résultats des tests RT-PCR par les patients pourraient donc être supérieurs à ceux mesurés via SIDEP. Les statistiques présentées portent sur l’ensemble des tests RT-PCR réalisés, en date de validation du résultat.

Depuis le 17 octobre, les tests antigéniques sont autorisés dans le cadre des dépistages individuels. Ils doivent être remontés depuis lors dans la base SIDEP par les laboratoires. En revanche, la saisie d’information dans SIDEP pour les professionnels de santé n’est possible que depuis le 16 novembre, et a connu une phase de montée en charge. Afin d’estimer le nombre total de tests antigéniques réalisés depuis le 17 octobre, la DREES utilise les données de l’Assurance maladie sur le nombre de tests remboursés en date de soins en complément des données renseignées dans SIDEP. Les tests antigéniques sont des tests pour lesquels le résultat est connu très rapidement, avec un délai entre prélèvement et validation du résultat généralement inférieur à 30 minutes.

Par ailleurs, si une même personne a réalisé successivement deux tests, ces deux tests sont donc comptés. Les données sur le nombre de tests diffèrent de celles publiées par Santé Publique France, en date de prélèvement du test.

Enfin, entre début mars et début juin 2020, préalablement au déploiement complet de SIDEP, la DREES a mis en place à la demande du centre de crise sanitaire un système d’information permettant de comptabiliser le nombre de tests RT-PCR réalisés en France, à partir des déclarations des sites réalisant les tests (et non les prélèvements comme dans SIDEP).

Dans le cadre de l'exploitation des données SIDEP, la DREES procède à quelques retraitements des données. En particulier, les tests remontés avec un pseudonyme manquant sont supprimés. Dans le cas d'un même test remonté plusieurs fois (mise à jour de certaines informations sur le patient par exemple), la DREES conserve la ligne la plus récente, à l'exception de la date d'intégration dans SIDEP dont on retient la valeur la plus ancienne, assimilée à la date de validation du résultat.

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