En trois semaines, le nombre de tests RT-PCR a été divisé par deux ; les délais entre prélèvement et validation des résultats des tests se sont encore réduits et atteignent les niveaux les plus favorables observés depuis juin dernier

Paru le 03/12/2020

Résumé

Entre le 1er mars et le 29 novembre 2020, on estime que plus de 28 millions de tests RT-PCR ont été réalisés en France. Au cours de la semaine du 23 au 29 novembre, 1 129 000 tests RT-PCR ont été validés, un nombre en baisse (-263 000) par rapport à la semaine précédente. En trois semaines, dans un contexte de confinement, le nombre de tests RT-PCR a ainsi été divisé par deux. Cette baisse a été en partie compensée par la montée en charge des tests antigéniques, dont le nombre approcherait les 200 000 sur la dernière semaine de novembre.

 

Les délais entre prélèvement et validation des résultats des tests RT-PCR continuent de se réduire significativement

Entre le 23 et le 29 novembre, 71 % des tests RT-PCR validés ont été prélevés dans les 24h qui précèdent (contre 66 % la semaine du 16 au 22 novembre), un niveau jamais atteint depuis que les données sur les délais existent et sont exploitables (juin 2020). La part des tests validés en moins de 48h augmente encore légèrement : 95 % contre 93 % la semaine précédente, tout comme celle des tests validés en moins de 72h : 98 % contre 97 % la semaine précédente. La médiane et la moyenne des délais entre prélèvement et validation du résultat sont stables (moyenne à 0,9 jour et médiane à 0,8 jour).

Méthodologie
La DREES exploite les données pseudonymisées du système d’information SI-DEP, qui portent notamment sur l’ensemble des tests RT-PCR réalisés par les laboratoires d’analyse médicale, et comportent des informations à la fois sur les résultats des tests et sur leurs délais de réalisation. Le calcul des délais se fait à partir de la date de prélèvement du test (jour, heure, minute), déclarée par le laboratoire, et de la date d’intégration (jour, heure, minute) du test dans le système d’information, intégration qui doit se faire très rapidement après la validation du test.

Les statistiques présentées portent sur l’ensemble des tests RT-PCR réalisés, en date de validation du résultat. Si une même personne a réalisé successivement deux tests, ces deux tests sont donc comptés. Les données sur le nombre de tests diffèrent de celles publiées par Santé Publique France, en date de prélèvement du test. De plus, les délais ici présentés correspondent aux délais entre la date de prélèvement et la date d’intégration des résultats dans SI-DEP. Cependant, la date d’envoi des résultats aux patients par le laboratoire peut être postérieure à l’intégration des résultats dans SIDEP. Les délais entre date de prélèvement et réception des résultats par les patients pourraient donc être supérieurs à ceux mesurés via SIDEP.

Enfin, entre début mars et début juin 2020, préalablement au déploiement complet de SIDEP, la DREES a mis en place à la demande du centre de crise sanitaire un système d’information permettant de comptabiliser le nombre de tests réalisés en France, à partir des déclarations des sites réalisant les tests (et non les prélèvements comme dans SIDEP).

Dans le cadre de l’exploitation des données SIDEP, la DREES procède à quelques retraitements des données. En particulier, les tests remontés avec un pseudonyme manquant sont supprimés. Dans le cas d’un même test remonté plusieurs fois (mise à jour de certaines informations sur le patient par exemple), la DREES conserve la ligne la plus récente, à l’exception de la date d’intégration dans SIDEP dont on retient la valeur la plus ancienne, assimilée à la date de validation du résultat.

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